十二年前，河督陆远峥遭奸臣恶意构陷，蒙受不白之冤，陆家惨遭满门抄斩。年仅十三岁的船家女子阿渔，受陆夫人临死前托付，抱着尚在襁褓的陆家遗孤陆归舟，驾一叶扁舟亡命于命运之河。二人藏身芦苇荒荡、大泽莲花坞，数次遭遇官兵严密搜捕，历经狂风巨浪翻船、寒冬重疾险些丧命等重重劫难。阿渔拼尽全力以命守护孩子，也因此落下终身病根，苦心将陆归舟抚育长大，还教他练就一身超凡水性。十二年时光匆匆而过，一枚随身玉佩意外暴露行踪引来杀身之祸。陆归舟得知全部身世后毅然奔赴京城，在盛大的龙舟大典上冒死拦驾告御状，层层举证拨开迷雾，终于为含冤离世的父亲洗刷冤屈。漂泊了整整十二年的一叶孤舟，历经万般风雨，终安稳归岸。